整个控制系统分两个控制部分，强电部分设计在楼顶，弱电部分设计在室内。根据控制目的配置一套监控显示放置在值班室内。楼顶控制器与值班室内之间通过串口通讯，对水位、水温、电流、电压等信号进行采集，根据控制要求判断水位、水温等信号，并通过开关量输出模块控制相应的太阳能循环泵运行，电辅助自动加热，供水回水循环泵启停的动作，并达到报警等功能。
控制系统采用工程专用仪表与优质电器组合而成，实现了强弱电分离，远程控制。系统可以自动启动和停止。辅助电加热可以根据时间和温度自动启动和停止。系统设有漏电开关，设计防雷、防漏电功能
电控系统电器部件采用优质正泰产品，控制系统采用我公司自行开发的KING-C型控制仪表。
控制系统显示功能：
★防冻指示灯：有防冻输出时，指示灯亮，否则不亮。检测管道的温度，并进行循环，防止管道温度过低管道冻结
★上水指示灯：上水时指示灯亮，否则不亮。防干烧进水：当满足加热条件，但水位低于最低安全水位时，自动打开进水至安全水位；无水进水：当水位显示为“0”时，立即进水至安全水位；
★循环指示灯：有循环输出时亮，否则不亮。自动检测集热器与储水箱之间的温差，并自动进行循环
★供水指示灯：有供水输出时，指示灯亮，无供水输出不亮。
★参数设置指示灯：设置参数时亮，其余时间不亮。
★加热指示灯：定温加热时亮，否则不亮。温度控制：水温低于设置温度5℃时自动加热，达到设置温度时自动停止加热；智能电热：在定时灯亮时，判断是否需要电热
★水位指示灯：设置水位时，闪烁显示设定水位，否则显示实际水位；
★水位传感器短路时：满水指示灯闪烁，其余熄灭；
★水位传感器断路时：3/5水位指示灯闪烁，其余熄灭；
★防漏电三重保护,防干烧保护,缺水保护、防冻保护